Gaussian入门(三)—模型建立(高斯建模)

  • 有单晶结构:从cif文件建立
  • 无单晶结构:GaussView建模
  • ChemOffice建模

一、GaussView简介

1、GaussView的功能

  • Gaussian的配套可视化工具
  • 计算模型的建立
  • 输入文件的建立
  • 结果的可视化
  • 轨道图形的查看
  • 振动模式的归属
  • 光谱结果的查看

Gaussian入门(三)---模型建立(高斯建模)

2、GaussView注意事项

不建议用Calculate向Gaussian提交计算任务

  • 有冗余坐标
  • 有些非必须关键词
  • 输出信息并未指定

Gaussian入门(三)---模型建立(高斯建模)

二、从cif文件建立模型

1、单晶数据来源

  • CCDC官网查询已有的单晶结构下载 https://www.ccdc.cam.ac.uk/
  • 离线软件CSD下载
  • 最新的文献报道的单晶
  • X-射线单晶衍射

2、步骤

  • 用diamond等打开cif文件,取出结构单元
  • 保存为.mol,.mol2文件格式
  • 用GaussView打开再保存为.gif文件

3、从ChemOffice建模

  • 使用ChemDraw建立平面结构
  • 导入Chem3D显示3D结构
  • 保存为.mol2格式
  • 使用GaussView打开,保存为.gif格式

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