Gaussian入门(三)—模型建立(高斯建模)
- 有单晶结构:从cif文件建立
- 无单晶结构:GaussView建模
- ChemOffice建模
一、GaussView简介
1、GaussView的功能
- Gaussian的配套可视化工具
- 计算模型的建立
- 输入文件的建立
- 结果的可视化
- 轨道图形的查看
- 振动模式的归属
- 光谱结果的查看
2、GaussView注意事项
不建议用Calculate向Gaussian提交计算任务
- 有冗余坐标
- 有些非必须关键词
- 输出信息并未指定
二、从cif文件建立模型
1、单晶数据来源
- CCDC官网查询已有的单晶结构下载 https://www.ccdc.cam.ac.uk/
- 离线软件CSD下载
- 最新的文献报道的单晶
- X-射线单晶衍射
2、步骤
- 用diamond等打开cif文件,取出结构单元
- 保存为.mol,.mol2文件格式
- 用GaussView打开再保存为.gif文件
3、从ChemOffice建模
- 使用ChemDraw建立平面结构
- 导入Chem3D显示3D结构
- 保存为.mol2格式
- 使用GaussView打开,保存为.gif格式
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